০১. সাধারন শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০২. এস এ শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৩. এল এ শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৪. স্থানীয় সরকার শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৫. সংস্থাপন শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৬. মাঠপ্রশাসন শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৭. নেজারত শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৮. হিসাব শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
০৯. আইসিটি শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১০. পত্র প্ররণ ও গ্রহণ শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১১. বিলুপ্ত ও উন্নয়ন শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১২. ডিএসবি শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১৩. লাইব্রেরী শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১৪. আপিল শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১৫. বাংলো গোপনীয় শাখা, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
১৬. এপিএ সেল, বিভাগীয় কমিশনারের কার্যালয়, খুলনা।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস